Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms