Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms