Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Plxna4Q80UG2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms