Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp8Q80U87 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp8Q80U87 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms