Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NischQ80TM9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
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