Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2q1Q7TSS2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms