Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccp110Q7TSH4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccp110Q7TSH4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms