Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1bQ7TSF1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dsg1bQ7TSF1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1bQ7TSF1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms