Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ckap2lQ7TS74 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms