Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HhipQ7TN16 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms