Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shq1Q7TMX5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shq1Q7TMX5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms