Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TwistnbQ78WZ7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TwistnbQ78WZ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms