Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim12Q78RX3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim12Q78RX3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim12Q78RX3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms