Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Higd1cQ76I25 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms