Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnih3Q6ZWS4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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