Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinlQ6ZQ12 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NinlQ6ZQ12 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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