Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc44a1Q6X893 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc44a1Q6X893 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms