Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms