Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Timd4Q6U7R4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timd4Q6U7R4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Timd4Q6U7R4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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