Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bnip1Q6QD59 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bnip1Q6QD59 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms