Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms