Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HjurpQ6PG16 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HjurpQ6PG16 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HjurpQ6PG16 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HjurpQ6PG16 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms