Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RimklaQ6PFX8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RimklaQ6PFX8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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