Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasa4Q6PFQ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms