Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gramd2bQ6PEM6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gramd2bQ6PEM6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms