Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SvoplQ6PDF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SvoplQ6PDF3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms