Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trak1Q6PD31 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak1Q6PD31 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms