Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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