Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Usp49Q6P9L4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Usp49Q6P9L4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp49Q6P9L4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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