Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg2aQ6P4T0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms