Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms