Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HelbQ6NVF4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HelbQ6NVF4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms