Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd11Q6NS46 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms