Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CltbQ6IRU5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms