Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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