Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw2Q6I6G8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms