Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nomo1Q6GQT9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nomo1Q6GQT9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms