Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg9bQ6EBV9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms