Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6DFW0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6DFW0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms