Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep170Q6A065 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep170Q6A065 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms