Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms