Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sv2cQ69ZS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sv2cQ69ZS6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sv2cQ69ZS6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms