Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrcc1Q69ZB0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms