Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk13Q69ZA1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk13Q69ZA1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms