Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brsk2Q69Z98 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms