Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Knl1Q66JQ7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms