Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VclQ64727 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VclQ64727 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms