Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PtprdQ64487 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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PtprdQ64487 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms