Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ift52Q62559 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms