Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Znf260Q62513 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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